Pengundian nomor urut yang digelar dalam rapat pleno terbuka tersebut dilakukan dalam 3 tahap. Mulai dari registrasi, pengundian hingga pada pencabutan nomor urut.
Tahap pertama utusan dari kandidat mencabut undian pertama di kotak yang berisikan 9 bola yang menandakan Pemilukada tanggal 9. Kemudian tahap kedua, pencabutan nomor undian kotak kedua oleh calon wakil Bupati yang berisikan 12 bola yang menandakan bulan 12 atau bulan Desember. Setelah melalui dua tahapan tersebut, barulah masuk pada tahap ke 3 dimana para kandidat calon bupati masing-masing mencabut 1 amplop dari 3 amplop yang disiapkan.
- Pasangan Ir Hendrik Mambor MM dan Adolof Viktor Betay (HEBAT) nomor urut 1.
- Pasangan Drs Bernadus Alkhatib Imburi M.Si bersama DR Drs Paulus Yulius Indubri MM (BP) mendapat nomor urut 2.
- Pasangan Drs Andarias Kayukatui M.Si bersama Dra Flora Rumbekwan (Andika-Flora) mendapat nomor urut 3.